海倫農業生態實驗站
海倫站建于1978年2月，定名為中國科學院黑龍江農業現代化研究所海倫工作站。“八五”期間，海倫站成為院中國生態系統研究網絡基本站之一，1990年更名為中國科學院海倫農業生態實驗站，隸屬于原黑龍江農業現代化研究所，是目前國內唯一從事黑土農業生態系統長期定位監測與研究的野外臺站。
沈陽生態實驗站
中國科學院沈陽生態實驗站建于1987年，并分別于1992年和1997年進入中國生態系統研究網絡的重點站和開放站的行列。該站隸屬于中國科學院沈陽應用生態研究所，位于遼寧省沈陽市蘇家屯區十里河鎮。
哀牢山亞熱帶森林生態系統研究站
1981年建站。位于哀牢山國家級自然保護區北段山頂部，在云南思茅市景東縣境內，海拔2450m，隸屬于中國科學院西雙版納熱帶植物園。哀牢山站地處西南季風氣候區，屬亞熱帶山地氣候。
西雙版納熱帶雨林生態系統定位研究站
研究站位于云南省西雙版納傣族自治州勐臘縣勐侖鎮三面環水、風光旖旎的葫蘆島上（中國科學院西雙版納熱帶植物園內），地理位置為東經101°25′，北緯21°41′，海拔570米。植被類型為熱帶季節雨林、季雨林。
內蒙古草原生態系統定位研究站
實驗站位于內蒙古錫林郭勒盟白音錫勒牧場境內，經緯度為43°38′E，116°42′N，海拔1187m。該區氣候為溫帶半干旱大陸性草原氣候，年均溫0.2℃，夏季溫涼，冬季寒冷，年均降水量350m。
海北高寒草甸生態系統定位研究站
位于N37°37'，E101°19'，地處祁連山東段北支冷龍嶺南麓，大通河河谷的西北部。冷龍嶺與大坂山聳立于站的南北兩側，山地平均海拔4000米，冷龍嶺主峰崗什卡海拔5254.5m，常年積雪，并發育著現代冰川。
沼澤生態站
三江平原沼澤濕地生態試驗站
建于1986年，隸屬于中國科學院長春地理研究所，地處我國我國最大的沼澤濕地集中區－三江平原，站區（133°31′E，47°35′N）位于別拉洪河與濃江的河間地帶。
鄂爾多斯沙地草地生態定位研究站
位于內蒙古鄂爾多斯高原毛烏素沙地的東北緣，隸屬于中國科學院植物研究所，地理位置39°29′37.6″N，110°11′29.4″E，海拔高度：1300 a.s.l.，處于一個多層次，即包括大氣環流系統、氣候、地質地貌、土壤、植被與自然地帶、生物區系、產業與社會文化等方面的復雜生態地理過渡帶。
東湖湖泊生態系統試驗站
1980年正式建站，東湖站地處長江中游（30°33′N, 114°23′E），海拔高程18米，重點研究水域之一的武漢東湖（面積27.8 km2 ，水深2-4米）是長江中下游典型的淺水湖泊。
太湖湖泊生態系統試驗站
隸屬于中國科學院南京地理與湖泊研究所，由本部和分部組成。無錫本部位于長江流域下游我國五大淡水湖泊梅梁湖的東岸（31°24′N，120°13′E），東太湖分部位于蘇州，地處東太湖湖灣的西岸。
城市生態站
北京城市生態系統研究站
位于位于北京市海淀區雙清路18號，東經115°26′，北緯39°58′。北京地貌東南部為平原，西北部為山地。氣候屬于暖溫帶半濕潤氣候。多年平均氣溫為11.7攝氏度，年平均降水585毫米。