檢驗達爾文
波珀已經指出了，一種理論如果只能解釋已知的事實，那么充其量也只不過是一種歷史解釋。這一點確實是對的。但是，波珀并沒有告訴我們，什么是科學。
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尼安德特人 |
那么，什么是科學呢？
絕大多數科學家認為，一種能夠預測尚未觀察到的現象的理論也是科學。這樣的科學理論是可以被反證的。如果預測的事情不可能發生，或是根本不存在，或是實驗的結果與理論的預測相矛盾，那么這個理論的錯誤也可以改正。反過來，如果證實預測的新發現能夠持續增加，這個理論也就越來越逼近真理了。
從這一點來看，達爾文所設想的地球上所有生物擁有共同祖先的現象是科學理論。
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露茜 |
就人類而言，達爾文設想，人類和猿猴是由一個共同的祖先發展而來的。1833年，當達爾文第一次簡略地寫下他這一遺傳思想的時候，任何與我們智人所不同的骨骼化石還都沒有被科學家發現。因此達爾文的理論在當時簡直就像神話一樣離奇。達爾文預言，如果發現了此類化石，那么它們肯定是介于猿猴和人類之間。1857年，也就是在《物種起源》正式發表的前兩年，一個新的智人亞種--尼安德特人被發現了。這第一個被找到的“缺失的環節”看上去確實有點像猿猴，當其頭骨和部分身體骨骼第一次展出在波昂的一次德國科學會議上時，一些科學家懷疑他并不屬于真正的人類，另一些科學家則認為這只是一種反常現象。但是，地質學家萊伊爾相信，“新發現的猿人骨骼與正常的標準人類結構的差異并不是一種偶然的或隨機的畸形。如果變異法則正好合乎進化論者的要求，那么這種差異正是意料之中的。”
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黑猩猩 |
如果我們把“實驗”一詞定義為檢驗某種假說的過程，那么為了驗證某種預測而進行的探索與研究就是一種實驗。從尼安德特人的發現開始，科學家在歐洲、非洲和亞洲都進行了大量的對人類和前人類化石的研究，一系列的古人類化石發現已經充分證實了達爾文的預言，因為每發現一個更為古老的化石，其解剖結構就越來越接近猿猴。其中最著名的“露茜”所代表的最早的人科--南方古猿，在300萬年前就已經能夠像現代人一樣直立行走，但是其頭骨卻依然保留著猿猴的特點，以至于很容易被誤認為是黑猩猩的頭骨。
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大猩猩 |
古人類學現代所采用的基本驗證工作與達爾文時代并沒有什么區別，都是通過骨骼的比較來進行。但是在最近的幾十年里，科學技術的發展已經為檢驗共同祖先的遺傳理論帶來了更精密的技術手段。生物化學揭示出進化是通過脫氧核糖核酸的變化來完成的，而脫氧核糖核酸的差異又顯示了不同物種之間在生物化學和形態學方面的差異；醫生在進行輸血及器官移植時為了檢驗是否適用于病人而必須使用的免疫學方法可以用來測定物種之間的差別；分子生物學則不僅能夠用來估算物種之間的相關程度，而且還能夠用來測定兩個物種從共同祖先開始分化時的時間。
這些新方法和新技術厘定了人類、猿類和猴子三者之間的關系。黑猩猩與人類的關系最近，它們和人類是從700萬年前的共同祖先分化開來的；再向前推200萬年，大猩猩又從那時的共同祖先分化出去；其他的猿類在時間上和親緣關系上與人的距離要更遠一些，而猴子就比猿類還要遠了。
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獸孔類 |
達爾文的共同祖先理論可以應用到地球上的整個生物界。根據比較解剖學的研究，科學家推測一種生活在2億年前的溫血的兩足行走的爬行動物是恐龍和鳥類的共同祖先。爬行動物與哺乳動物之間則由一種屬于似哺乳爬行類的獸孔類聯系起來。獸孔類曾經在2億5千萬年前主宰地球。
按這樣的方法，物種之間的聯系還可以繼續向更遙遠的年代追溯，最后都歸結到細菌。最古老的細菌化石發現在30多億年前，是地球上發現的所有生命形式當中最為古老的。
地球上曾經存在的仍然存在的所有生命都源于同一種原始生命形態的推斷在DNA中也得到了戲劇性的證實。生物化學告訴我們，各種生物的生命過程都是一樣的。
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